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小分子肝素和普通肝素的不同，包括以下幾個方面：
1、分子量：小分子肝素的分子量比較小，一般在5000D以下。普通肝素的分子量比較大，一般在5000-30000D。
2、副作用：在臨床中用于抗凝時，這兩種藥物都比較常用，小分子肝素的副作用更小，普通肝素副作用相對較大，會有血小板的減少和出血。
3、價格及半衰期影響：小分子肝素的價格比普通肝素要貴，所以，如果臨床中不考慮價錢因素，建議選擇小分子肝素作為抗凝藥物。因為它對血小板的影響較小，可能引起出血的風險也小，而且小分子肝素的半衰期也比普通肝素的半衰期要長。