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胃腸道間質瘤如治療得當，有痊愈的可能性。具體預后與腫瘤大小、分期、治療效果有關，胃腸道間質瘤惡性程度不高，但術后易轉移、復發(fā)。臨床統(tǒng)計數(shù)據(jù)顯示胃腸道惡性間質瘤，10年生存率在48%，如生長在食管、胃部，治療效果相對較好，10年生存率在70%以上；若生長在腸道內，10年生存率僅為17%左右，僅有部分患者能夠痊愈。