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導(dǎo)致新生兒發(fā)生敗血癥的常見病原菌有B族鏈球菌、金黃色葡萄球菌、表皮葡萄球菌、肺炎克雷伯菌、大腸埃希氏菌等，有些情況下也可以由綠膿桿菌等引起。
根據(jù)不同感染的部位以及不同的地區(qū)常見流行的菌種不同，導(dǎo)致新生兒感染的病原菌也不一樣，尤其是由新生兒肺炎導(dǎo)致的敗血癥往往和B族鏈球菌是密切相關(guān)的。如果是泌尿道感染引起新生兒敗血癥，和大腸埃希氏菌及肺炎克雷伯菌等密切相關(guān)。
所以新生兒敗血癥病原菌除了和原發(fā)病有關(guān)之外，其次和當(dāng)?shù)厮餍械木晔怯忻芮嘘P(guān)系的。